Sono organi della Congrega della Carità Apostolica:

- il Sodalizio dei Confratelli
- il Collegio degli Amministratori
- il Presidente
- il Collegio dei Revisori dei Conti

Con la denominazione tradizionale, lo Statuto dell'ente identifica nel Sodalizio il ruolo e le funzioni dell'Assemblea e nel Collegio quelle del Consiglio di Amministrazione.

Comitato di presidenza in carica per il triennio 2010-2012:

- prof. Mario Taccolini (Presidente)

- dott. Renzo Catellani (Vice Presidente)

- avv. Attilio Franchi (Vice Presidente)